Les Contrats Doctoraux remplacent les "Allocations de Recherche" depuis juin 2009. Ils sont proposées sur concours au sein de l'École doctorale pour les candidats admis à continuer en thèse. Ce concours est également ouvert aux normaliens et aux polytechniciens, mais ceux-ci doivent commencer par candidater à une allocation couplée (AC, AMX).
Les candidats doivent se faire connaître du directeur du M2 et du secrétariat au début du 2nd semestre de leur année de M2. Les actes de candidature proprement dits sont déposés en juin auprès du secrétariat de l'École doctorale, et doivent être accompagnées d'un rapport du futur directeur de recherches.
Le classement est dans la pratique effectué par l'École doctorale début juillet. Les candidats à cette allocation devraient donc avoir achevé leur M2, stage compris, à la session de juin.
On trouvera plus d'informations sur cette page du site de l'École Doctorale.